Dù hàng ngàn người bị giam trong Tháp, nhưng chỉ có năm phụ nữ và hai người đàn ông bị chém đầu trong khu vực của Tháp, để tránh bị sỉ nhục do việc hành hình trước công chúng. Trong số những phụ nữ này là các hoàng hậu Anne Boleyn, Catherine Howard và nữ hoàng Jane Grey, lên ngôi chỉ được có 9 ngày.
-Đồi Tower Hill.
Phần lớn những cuộc hành hình khác, thường là chém đầu diễn ra ở Tower Hill, một ngọn đồi gần đó trước một đám đông hỗn độn. Đầu bị bêu trên ngọn giáo được đặt ở Cầu Luân Đôn như một lời cảnh báo, còn thi thể thì đem về chôn dưới nền của một nhà thờ nhỏ trong Tháp. Có hơn 1.500 thi thể đã được chôn ở đó.
-Cầu Luân Đôn.
Trường với sự đồng ý của cấp trên, trỉnh thoảng tù nhân bị traa tấn để cung khai. Vào năm 1605, vì toan làm nổ tung nghị viện và ám sát vua trong một âm mưu gọi là:''Gunpowder Plot'', ông Guy Fawkes bị kéo căng trên một loại dụng cụ tra tấn nhằm khai ra tên những kẻ đồng lõa - sau đó ông cũng bị hành hình.
-vụ án ''Gunpowder Plot'' cùng với nhân vật Guy Fawkes.
Vào những năm 1600, ông Oliver Cromwell và phe nghị viện lên nắm quyền Anh Quốc và chiếm Tháp, nhưng chỉ được một thời gian ngắn. Sau đó, vua Charles II chiếm lại ngai vàng. Dưới triều ông số từ nhân trong Tháp giảm đi.
-vua Charles II.
Tù nhân cuối cùng bị chém đầu tại đồi Tower Hill là vào năm 1747, nhưng về sau Tháp vẫn đóng vai trò là nhà giam.
Trong thế chiến thứ I, 11 gián điệp người Đức đã bị giam ở đó và bị xử bắn.
Trong thế chiến II, Tháp là nơi tạm giam tù nhân chiến tranh trong đó có Rudolf Hess, cánh tay đắc lực của Hitler. Vào tháng tám năm 1941, tù nhân cuối cùng bị xử bắn tại Tháp là gián điệp Joseph Jakobs.